Organizátoři olympiády připravili závodníkům specifický formát soutěže. Každá disciplína měla dvě fáze a o výsledném pořadí rozhodoval součet výkonů z obou fází. Ale zatímco u všech technických disciplín, běhů na 100 až 800 metrů i v chůzi na 5000 metrů absolvovali závodníci jako druhou fázi svou vlastní (!!!) disciplínu, v závodech na 1500, 3000 a 2000 metrů překážek absolvovali závodníci v první fázi disciplínu, na kterou byli nominováni, druhou fází pak pro ně byl čtyřkilometrový kros a o výsledném pořadí v "jejich" disciplíně rozhodoval součet umístění z obou fází. Vzhledem k rozdílnosti obou disciplín tak organizátoři běžcům prakticky uspořádali jakýsi "běžecký dvojboj". Kros byl navíc vyhodnocen jako samostatná disciplína, takže se dala předpokládat převaha běžců z distančně nejbližší trati, tedy 3000 metrů.

Před vlastním zahájením YOGu, které proběhlo za přihlížení tisíců návštěvníků (odhady hovoří o 200 tisících) 6. října na náměstí Plaza de la República, strávila česká výprava v dějišti her týden. Ten byl věnován aklimatizaci (časový posun oproti ČR činí 5 hodin) a ladění formy. Při první konfrontaci se "světovou" konkurencí bylo Ondrovým cílem umístění v první polovině startovního pole a dosažení času na úrovni osobního rekordu. Start stýplu chlapců byl stanoven na 12. října 15 hodin...

Hned po startu se vedení ujal favorizovaný etiopan Abrham Sime Tufa a brzy se začal zbytku startovního pole vzdalovat. Ondra v prvních kolech závodu běžel podle plánu v polovině hlavního pole a metu prvního kilometru překonal v čase 2:55. Pak se však začal projevovat poměrně značný tréninkový výpadek ze září způsobený zdravotními problémy, Ondra mírně zpomalil a v poli závodníků se začal propadávat. Ale v závěrečné fázi závodu ještě dokázal zmobilizovat zbytek sil a posunul se o několik pozic vpřed. Cílem proběhl na devátém místě v čase 5:51,78, tedy přibližně 1,2 vteřiny za svým osobním rekordem. Vítězný etiopan dosáhl času 5:34,84 a druhému v pořadí tak "nadělil" téměř deset vteřin...

Start druhé fáze "běžeckého dvojboje", 4000 m cross country, byl naplánován na pondělí 15. října na 10:00. Běžci měli absolvovat padesátimetrový seběh od startovní čáry a dále pět okruhů dlouhých osm set metrů. Ondrovým cílem bylo udržet celkové pořadí do desátého místa, což byl, vzhledem k tomu, že se krosům nevěnuje a běhá je pouze jako doplněk jarní a podzimní přípravy, těžký úkol. Navíc není silový typ běžce, takže jeho účast na krosu by se dala přirovnat k nasazení automobilového silničního speciálu na rallye... Od začátku se mu nedařilo držet rovnoměrné tempo a postupně zpomaloval. Jednotlivé okruhy proběhl v časech 2:34, 2:28, 2:37, 2:41, 2:34 a celkově doběhl 43. Na trati dominovali talentovaní "mladíci" z Afriky, kteří obsadili prvních devět míst. Z "neafričanů" se nejlépe umístil japonec Ishida desátý. Potvrdil se i předpoklad, že trať bude nejvíce vyhovovat účastníkům z 3000 metrů, ti v krosu obsadili 1., 2., 3., 5., a 8. místo. Běžci jejichž disciplínou bylo 1500 metrů obsadili 4., 6. a 10 . místo a nejrychlejší stýplař skončil devátý...

LV